A Unidade de Vigilância Epidemiológica (VEP) promove a identificação de necessidades no domínio da vigilância epidemiológica das doenças transmissíveis e não transmissíveis e suas determinantes.
Realiza actividades de vigilância epidemiológica, nomeadamente da gripe, da mortalidade diária, dos efeitos de factores ambientais, como o calor e de outras situações que lhe são cometidas, no âmbito da função estratégica da observação de saúde.
Interpreta o significado dos resultados obtidos na vigilância e divulga-os às entidades adequadas em tempo útil.