O Fiscal Único é órgão responsável pelo controlo da legalidade, da regularidade e da boa gestão financeira e patrimonial do INSA, IP, sendo nomeado obrigatoriamente de entre revisores oficiais de contas ou sociedades de revisores oficiais de contas, por despacho conjunto dos membros do Governo da área das finanças e da saúde.
O mandato do fiscal único tem a duração de três anos e é renovável por uma única vez.
Por despacho n.º 1518/2009, é nomeado fiscal único do INSA, IP, a sociedade de revisores oficiais de contas Pedro Leandro & António Belém, SROC, representada por António Maria Velez Belém.